mailr3830 - /1.3/test_suite/unit_tests/sequence_testing_base.py


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Posted by edward on November 22, 2007 - 18:02:
Author: bugman
Date: Thu Nov 22 18:02:47 2007
New Revision: 3830

URL: http://svn.gna.org/viewcvs/relax?rev=3830&view=rev
Log:
Fix for the unit test of reading of the amino acid sequence out of a protein 
NOE data file.


Modified:
    1.3/test_suite/unit_tests/sequence_testing_base.py

Modified: 1.3/test_suite/unit_tests/sequence_testing_base.py
URL: 
http://svn.gna.org/viewcvs/relax/1.3/test_suite/unit_tests/sequence_testing_base.py?rev=3830&r1=3829&r2=3830&view=diff
==============================================================================
--- 1.3/test_suite/unit_tests/sequence_testing_base.py (original)
+++ 1.3/test_suite/unit_tests/sequence_testing_base.py Thu Nov 22 18:02:47 
2007
@@ -74,28 +74,28 @@
         self.sequence_fns.read(file='Ap4Aase.Noe.600.bz2', 
dir='../shared_data/relaxation_data')
 
         # Test parts of the sequence.
-        self.assertEqual(relax_data_store['test'].mol[0].res[0].num, 1)
-        self.assertEqual(relax_data_store['test'].mol[0].res[0].name, 'GLY')
-        self.assertEqual(relax_data_store['test'].mol[0].res[0].num, 2)
-        self.assertEqual(relax_data_store['test'].mol[0].res[0].name, 'PRO')
-        self.assertEqual(relax_data_store['test'].mol[0].res[0].num, 3)
-        self.assertEqual(relax_data_store['test'].mol[0].res[0].name, 'LEU')
-        self.assertEqual(relax_data_store['test'].mol[0].res[0].num, 4)
-        self.assertEqual(relax_data_store['test'].mol[0].res[0].name, 'GLY')
-        self.assertEqual(relax_data_store['test'].mol[0].res[0].num, 5)
-        self.assertEqual(relax_data_store['test'].mol[0].res[0].name, 'SER')
-        self.assertEqual(relax_data_store['test'].mol[0].res[0].num, 90)
-        self.assertEqual(relax_data_store['test'].mol[0].res[0].name, 'GLU')
-        self.assertEqual(relax_data_store['test'].mol[0].res[0].num, 91)
-        self.assertEqual(relax_data_store['test'].mol[0].res[0].name, 'LYS')
-        self.assertEqual(relax_data_store['test'].mol[0].res[0].num, 92)
-        self.assertEqual(relax_data_store['test'].mol[0].res[0].name, 'LEU')
-        self.assertEqual(relax_data_store['test'].mol[0].res[0].num, 163)
-        self.assertEqual(relax_data_store['test'].mol[0].res[0].name, 'PRO')
-        self.assertEqual(relax_data_store['test'].mol[0].res[0].num, 164)
-        self.assertEqual(relax_data_store['test'].mol[0].res[0].name, 'ISS')
-        self.assertEqual(relax_data_store['test'].mol[0].res[0].num, 165)
-        self.assertEqual(relax_data_store['test'].mol[0].res[0].name, 'LEU')
+        self.assertEqual(relax_data_store['orig'].mol[0].res[0].num, 1)
+        self.assertEqual(relax_data_store['orig'].mol[0].res[0].name, 'GLY')
+        self.assertEqual(relax_data_store['orig'].mol[0].res[0].num, 2)
+        self.assertEqual(relax_data_store['orig'].mol[0].res[0].name, 'PRO')
+        self.assertEqual(relax_data_store['orig'].mol[0].res[0].num, 3)
+        self.assertEqual(relax_data_store['orig'].mol[0].res[0].name, 'LEU')
+        self.assertEqual(relax_data_store['orig'].mol[0].res[0].num, 4)
+        self.assertEqual(relax_data_store['orig'].mol[0].res[0].name, 'GLY')
+        self.assertEqual(relax_data_store['orig'].mol[0].res[0].num, 5)
+        self.assertEqual(relax_data_store['orig'].mol[0].res[0].name, 'SER')
+        self.assertEqual(relax_data_store['orig'].mol[0].res[0].num, 90)
+        self.assertEqual(relax_data_store['orig'].mol[0].res[0].name, 'GLU')
+        self.assertEqual(relax_data_store['orig'].mol[0].res[0].num, 91)
+        self.assertEqual(relax_data_store['orig'].mol[0].res[0].name, 'LYS')
+        self.assertEqual(relax_data_store['orig'].mol[0].res[0].num, 92)
+        self.assertEqual(relax_data_store['orig'].mol[0].res[0].name, 'LEU')
+        self.assertEqual(relax_data_store['orig'].mol[0].res[0].num, 163)
+        self.assertEqual(relax_data_store['orig'].mol[0].res[0].name, 'PRO')
+        self.assertEqual(relax_data_store['orig'].mol[0].res[0].num, 164)
+        self.assertEqual(relax_data_store['orig'].mol[0].res[0].name, 'ISS')
+        self.assertEqual(relax_data_store['orig'].mol[0].res[0].num, 165)
+        self.assertEqual(relax_data_store['orig'].mol[0].res[0].name, 'LEU')
 
 
     def test_write_protein_sequence(self):




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