Index

AICc|seemodel selection, AICc
AIC|seemodel selection, AIC
angles , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
angles|textbf , [*]
anisotropic diffusion|seediffusion, anisotropic
ANOVA model selection|seemodel selection, ANOVA
API documentation
API documentation|textbf
argument
argument
keyword
asymmetric diffusion|seediffusion, ellipsoid (asymmetric)
Augmented Lagrangian|seeoptimisation, constraint algorithm, Method of Multipliers
axially symmetric diffusion|seediffusion, spheroid (axially symmetric)
Bayesian model selection|seemodel selection, Bayesian
BFGS|seeoptimisation, algorithm, BFGS
BIC|seemodel selection, BIC
bond length , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
Bootstrap model selection|seemodel selection, Bootstrap
branches|textbf
Brownian diffusion|seediffusion, Brownian
bug
design
report
search
tracker , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
tracker|textbf
bug|textbf
bzip2|seecompression, bzip2
C module compilation
C module compilation|seeSCons, C module compilation
C module compilation|textbf
camel case
Cauchy point|seeoptimisation, algorithm, Cauchy point
CG-Steihaug|seeoptimisation, algorithm, CG-Steihaug
chemical exchange , [*] , [*] , [*] , [*]
chi-squared , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
chi-squared gradient
chi-squared Hessian
chi-squared|textbf , [*] , [*] , [*]
clean up|textbf
commit access
commit log|textbf
compression , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
compression
bzip2 , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
gzip , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
uncompressed , [*] , [*] , [*]
consistency testing|textbf
constraint , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
copy , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
correlation time , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
cross rate|seerelaxation rate, cross rate
cross-relaxation|seerelaxation rate, cross-relaxation
cross-validation model selection|seemodel selection, cross-validation
ctypes
Dasha|seesoftware, Dasha
data pipe|textbf
delete , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
diff
diffusion
diffusion
anisotropic , [*] , [*] , [*]
Brownian , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
Brownian|textbf
ellipsoid (asymmetric) , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
ellipsoid (asymmetric)|textbf , [*] , [*]
sphere (isotropic) , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
sphere (isotropic)|textbf , [*] , [*] , [*]
spheroid (axially symmetric) , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
spheroid (axially symmetric)|textbf , [*] , [*] , [*]
tensor , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
direction cosine , [*]
discrepancy
discrepancy
Kullback-Leibler
display , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
distribution archive , [*] , [*]
distribution archive|textbf
doc string|textbf
dogleg|seeoptimisation, algorithm, dogleg
eigenvalues , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
ellipsoidal diffusion|seediffusion, ellipsoid (asymmetric)
Ensemble analysis|textbf
epydoc
Euler angles , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
exact trust region|seeoptimisation, algorithm, exact trust region
exponential curve fitting
Fletcher-Reeves|seeoptimisation, algorithm, Fletcher-Reeves
floating point number , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
forks|textbf
frame order
axis permutations
linear constraints|textbf
matrix , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
model nesting
model
double rotor|textbf
free rotor|textbf
isotropic cone, free rotor|textbf
isotropic cone, torsionless|textbf
isotropic cone|textbf
pseudo-ellipse, free rotor|textbf
pseudo-ellipse, torsionless|textbf
pseudo-ellipse|textbf
rigid
rigid|textbf
rotor|textbf
simulation|textbf
frame order|textbf
Frequentist model selection|seemodel selection, Frequentist
function class , [*] , [*] , [*]
git
git
check out
checkout
clone
conflict
manual
merge
git|textbf , [*]
GNU/Linux|seeOperating system, GNU/ Linux
Google
GPG
key
signature , [*]
GPL|textbf , [*] , [*]
Grace|seesoftware, Grace
gradient|textbf
GUI|seeUser interface, GUI
gzip|seecompression, gzip
help system , [*] , [*]
help system|textbf
Hessian|textbf
Hestenes-Stiefel|seeoptimisation, algorithm, Hestenes-Stiefel
Hypothesis testing model selection|seemodel selection, Hypothesis testing
indentation|textbf
installation|textbf
integer , [*]
interatomic data container|textbf
isotropic diffusion|seediffusion, sphere (isotropic)
keyword argument|seeargument, keyword
Kullback-Leibler discrepancy|seediscrepancy, Kullback-Leibler
Levenberg-Marquardt|seeoptimisation, algorithm, Levenberg-Marquardt
licence|textbf
linking|textbf
Linux|seeOperating system, GNU/Linux
list , [*]
Logarithmic barrier|seeoptimisation, constraint algorithm, Logarithmic barrier
longitudinal relaxation|seerelaxation rate, spin-lattice
Mac OS X|seeOperating system, Mac OS X
mailing list , [*] , [*]
mailing list
archive , [*] , [*] , [*] , [*]
relax-announce , [*] , [*]
relax-commits , [*] , [*]
relax-devel , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
relax-users , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
mailing list|textbf , [*]
make
manual
HTML
map , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
Method of Multipliers|seeoptimisation, constraint algorithm, Method of Multipliers
minfx|seeoptimisation, minfx
model elimination , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
model selection
model selection
AIC , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
AICc , [*] , [*]
ANOVA
Bayesian
BIC , [*] , [*]
bootstrap , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
cross-validation , [*] , [*]
frequentist
hypothesis testing
model-free analysis|textbf
Modelfree|seesoftware, Modelfree
modelling
molecular dynamics simulation
molecule , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
molecule|textbf , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
MOLMOL|seesoftware, MOLMOL
Monte Carlo simulation , [*] , [*] , [*]
Monte Carlo simulations|textbf
MPI
MPI
mpi4py
mpi4py|textbf
OpenMPI , [*] , [*] , [*]
OpenMPI|textbf
MS Windows|seeOperating system, MS Windows
multi-processor framework
N-state model|textbf
Nelder-Mead simplex|seeoptimisation, algorithm, Nelder-Mead simplex
Newton-CG|seeoptimisation, algorithm, Newton-CG
Newton-Raphson|seeoptimisation, algorithm, Newton
Newton|seeoptimisation, algorithm, Newton
NMR , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
NMRView|seesoftware, NMRView
NOE , [*]
NOE|textbf , [*]
NumPy
OpenDX|seesoftware, OpenDX
OpenMPI|seeMPI, OpenMPI
Operating system
GNU/Linux
GNU/Linux|textbf
Mac OS X
Mac OS X|textbf
MS Windows
MS Windows|textbf
Unix
optimisation , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
optimisation
algorithm
algorithm
BFGS , [*] , [*]
BFGS|textbf
Cauchy point|textbf
CG-Steihaug|textbf
conjugate gradient , [*] , [*]
coordinate descent|textbf
dogleg , [*]
dogleg|textbf
exact trust region , [*]
exact trust region|textbf
Fletcher-Reeves|textbf
grid search
alternating|textbf
low precision|textbf
zooming|textbf
Hestenes-Stiefel|textbf
Levenberg-Marquardt , [*]
Levenberg-Marquardt|textbf
Nelder-Mead simplex , [*] , [*] , [*] , [*]
Nelder-Mead simplex|textbf
Newton , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
Newton-CG
Newton-CG|textbf
Newton|textbf
Polak-Ribière|textbf
Polak-Ribière +|textbf
precision
zooming|textbf
steepest descent , [*]
steepest descent|textbf
algorithm|textbf
constraint algorithm
Logarithmic barrier
Logarithmic barrier|textbf
Method of Multipliers|textbf
minfx
minfx|textbf
space|textbf
step-length selection algorithm|textbf
topology|textbf
optimisation|textbf , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
optimise , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
order parameter , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
OS X|seeOperating system, Mac OS X
parameter convolution
parameter
bounds , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
limit , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
patches|textbf
PCS|seePseudo-contact shift
PDB , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
peak
height
intensity , [*] , [*] , [*]
volume
plot , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
Polak-Ribière +|seeoptimisation, algorithm, Polak-Ribière +
Polak-Ribière|seeoptimisation, algorithm, Polak-Ribière
Pseudo-contact shifts
Pseudo-contact shifts|textbf
PyMOL|seesoftware, PyMOL
pyreadline
Python , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
Python|textbf , [*] , [*]
R1@ R1|seerelaxation rate, spin-lattice
R2@ R2|seerelaxation rate, spin-spin
RDC|seeResidual dipolar couplings
read , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
reduced spectral density mapping
reduced spectral density mapping|textbf
regular expression , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
relaxation , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
relaxation curve-fitting|textbf
relaxation dispersion
relaxation dispersion
analytical model
experiment
R1ρ-type
CPMG-type
model category
analytic CPMG|textbf
analytic MMQ CPMG|textbf
analytic R1rho|textbf
base models|textbf
numeric CPMG|textbf
numeric MMQ CPMG|textbf
numeric R1rho|textbf
model
B14
B14 full
B14 full|textbf
B14|textbf
BK13
BK13 full
CR72
CR72 full
CR72 full|textbf
CR72|textbf
DPL94
DPL94|textbf
IT99
IT99|textbf
LM63
LM63 3-site
LM63 3-site|textbf
LM63|textbf
M61
M61 skew
M61 skew|textbf
M61|textbf
MMQ CR72
MMQ CR72|textbf
MP05
MP05|textbf
no Rex
no Rex|textbf
NS CPMG 2-site 3D
NS CPMG 2-site 3D full
NS CPMG 2-site 3D full|textbf
NS CPMG 2-site 3D|textbf
NS CPMG 2-site expanded
NS CPMG 2-site expanded|textbf
NS CPMG 2-site star
NS CPMG 2-site star full
NS CPMG 2-site star full|textbf
NS CPMG 2-site star|textbf
NS MMQ 2-site
NS MMQ 2-site|textbf
NS MMQ 3-site
NS MMQ 3-site linear
NS MMQ 3-site linear|textbf
NS MMQ 3-site|textbf
NS R1rho 2-site
NS R1rho 2-site|textbf
NS R1rho 3-site
NS R1rho 3-site linear
NS R1rho 3-site linear|textbf
NS R1rho 3-site|textbf
R2eff
R2eff|textbf
TAP03
TAP03|textbf
TP02
TP02|textbf
TP04
TSMFK01
TSMFK01|textbf
numerical model
relaxation dispersion|textbf
relaxation rate
cross rate
cross-relaxation|textbf
spin-lattice
spin-spin
relax|seesoftware, relax
repository , [*]
repository
branch versioning
branches|textbf
forks|textbf
keeping up to date
merging branch back
patches|textbf
rebasing
repository|textbf
Residual dipolar coupling
Residual dipolar coupling|textbf
RMSD
rotation , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
SciPy
SCons
SCons
API documentation|textbf
binary distribution
binary distribution|textbf
C module compilation|textbf
clean up|textbf
help|textbf
install|textbf
source distribution|textbf
user manual (HTML version)|textbf
user manual (PDF version)|textbf
SCons|textbf , [*] , [*]
scripting , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
scripting
sample scripts
script file , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
script file|textbf , [*]
sequence , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
sequence|textbf , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
simplex algorithm|seeoptimisation, algorithm, Nelder-Mead simplex
simulated annealing
software
Dasha , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
Dasha|textbf , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
Grace , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
Grace|textbf , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
Modelfree , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
Modelfree|textbf
MOLMOL , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
MOLMOL|textbf , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
NMRView , [*]
OpenDX , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
OpenDX|textbf , [*]
PyMOL
PyMOL|textbf , [*]
relax
Sparky , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
Tensor
XEasy , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
SourceForge
Sparky|seesoftware, Sparky
spherical angles
spherical diffusion|seediffusion, sphere (isotropic)
spheroidal diffusion|seediffusion, spheroid (axially symmetric)
spin container|textbf
spin-lattice relaxation|seerelaxation rate, spin-lattice
spin-spin relaxation|seerelaxation rate, spin-spin
standard deviation
steepest descent|seeoptimisation, algorithm, steepest descent
step-length|seeoptimisation, step-length selection algorithm
string , [*]
support request
tracker|textbf
SVN|seeSubversion
symbolic link
tab completion|textbf
tar , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
task
tracker|textbf
Tensor|seesoftware, Tensor
terminal
test suite , [*]
tracker
bug|textbf
support request|textbf
task|textbf
transverse relaxation|seerelaxation rate, spin-spin
under-fitting
Unix|seeOperating system, Unix
user functions , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
user functions|textbf
User interface
GUI
GUI|textbf , [*] , [*]
prompt|textbf , [*]
scripting|textbf , [*]
user manual
HTML compilation|textbf
PDF compilation|textbf
web site|textbf
Windows|seeOperating system, MS Windows
write , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*] , [*]
wxPython
XEasy|seesoftware, XEasy



The relax user manual (PDF), created 2019-06-14.